CleanNGS

Zestaw CleanNGS to wysoce wydajny system oczyszczania oparty o technologię kulek paramagnetycznych, do przygotowywania bibliotek NGS czy sekwencjonowania Sangera.  Może być również używany w technologii CRISPR-Cas9. CleanNGS zapewnia maksymalną elastyczność pozwalając również na selekcję fragmentów o odpowiedniej wielkości.

Zestaw CleanNGS jest wytwarzany w warunkach wolnych od RNaz, co pozwala również na oczyszczanie RNA . Dzięki prostemu, trzyetapowemu protokołowi CleanNGS usuwa sole, startery, dNTP, podczas gdy fragmenty DNA i/lub RNA są selektywnie wiązane do cząstek magnetycznych. Wysoce oczyszczony materiał DNA i/lub RNA jest eluowany buforem elucyjnym o niskiej zawartości soli lub wodą i może być używany bezpośrednio do dalszych zastosowań. Protokół można dostosować do automatycznych stacji pipetujących (np. Beckman, Hamilton, Tecan, Caliper, Perkin Elmer, Agilent i Eppendorf) lub wykonać procedurę ręcznie.

Właściwości

• Zaprojektowany do oczyszczania zarówno DNA jak i RNA 
• Idealny do selekcji fragmentów o odpowiedniej wielkości
• Wysoki odzysk amplikonów powyżej 100 pz
• Skutecznie usuwa niewykorzystane dNTP, startery i inne zanieczyszczenia
• Brak etapu wirowania lub filtracji

Amplikony oczyszczone za pomocą CleanNGSsystem są gotowe do użycia w następujących aplikacjach:

• PCR i RT-PCR
• Wykrywanie mutacji i genotypowanie
• Sekwencjonowaniu (Sanger i NGS) 
• Analizie fragmentów
• Mikromacierzach 
• Oczyszczaniu enzymami restrykcyjnymi
• Klonowaniu
• Transfekcja do eksperymentów z RNAi

W ramach CleanNGS wdrożyliśmy następujące modyfikacje:

1. CleanNGS zawiera kulki o wyższej zawartości żelaza, co umożliwia szybsze oddzielanie się kulek i sprawia, że pierścień kulki (w przypadku separacji za pomocą magnesu pierścieniowego) jest bardziej stabilny
2. CleanNGS ma zoptymalizowany system buforowania, gwarantujący najlepsze wyniki również w połączeniu z najnowszymi zestawami do przygotowywania bibliotek takich firm jak Illumina, NEB, KAPA itp.
3. CleanNGS jest produkowany bez RNaz, dzięki czemu zestaw może być również używany do czyszczenia RNA i oczyszczania cDNA i RNA wytworzonego in vitro.